他先是想全数赦免董卓的部下，可继而又对群臣解释说：“本来，他们是没有罪的，只是身不由己，跟从董卓，以是不得已服从董卓调派，犯了弊端。现在如果给他们俄然加上恶逆的罪名，并且特定赦免他们，恐怕反而使他们猜忌惊骇，心机接受不了，以是，赦免他们无罪不是使他们放心的上上之策，还不如让他们接受奖惩。”
王允与士孙瑞、杨瓒借登台拜神为名，又一次奥妙筹议拔除董卓的事件。士孙瑞说：“自从客岁年底以来，太阳不照，淫雨不竭已达六十多天，我们应当让这类倒霉国度和老百姓的期间尽快结束。现在，机会大好，我们正可趁天下沸腾之际，主动采纳办法，毁灭祸首祸首！”
李傕、郭汜追到宣平门下，叩首便拜。汉献帝壮起胆量扣问道：“你们目无国法，反叛都城，到底筹算何为么？”李傕答复说：“董太师对陛下忠心耿耿，却无缘无端遭人殛毙，我们只想替太师讨回公道，不敢造反。比及缉捕处决凶手后，我们情愿接管审判。”王允二话没说，向汉献帝行了最后的君臣大礼，便随兵士走下了城楼，李傕、郭汜号令部下当场将王允处决。
在初平三年（192年）玄月，又进封李傕为车骑将军、开府、领司隶校尉、假节、池阳侯，郭汜为后将军、美阳侯，樊稠为右将军、万年侯。张济被封为镇东将军、平阳侯，外出屯驻在弘农。以贾诩为左冯翊。自此长安和朝政已经掌控在李傕和郭汜的手中！
作为诛杀民贼的首要功臣，王允天然少不了朝廷的嘉赏和泛博群众的奖饰。因而，王允态度开端产生窜改，仿佛有些飘飘然起来：“连董卓如许不成一世的大奸贼都死于我的部下，我另有甚么可惊骇的呢？”他便对任何人、任何事情都无所谓，毫不在乎，乃至居功自大。“及在际会，每乏温润之色，杖正慎重，不循权宜之计，是以群下不甚附之。”每当群臣集会，王允很少像之前那样和大师推心置腹，共同参议权宜之计，而是正襟端坐，面无和悦之色。渐渐地，群臣也不再像之前那样推许和拥戴他了。
凉州百姓听到王允想闭幕凉州兵的风声后，便到处传言，说王允要杀掉统统凉州人，一时之间，全部凉州民气惶惑，一片惶恐。凉州兵将领本来就成了惊弓之鸟，对本身的前程深感忧愁，当他们得知王允要削夺他们的军权，闭幕凉州兵的动静后，更是惶恐。