洪承畴随杀黄道周，临刑前，道周望南而拜，痛声呼道：“臣黄道周拜别吾皇陛下。”他连拜九次后，痛涕道：“陛下啊～臣虽不能再驰骋疆场，为国立业，然忍耻被俘，也断无再生之理，臣死而无怨，望陛下重整朝纲，力挽狂澜，打扫奸雄，挥兵北进，圣朝安得无雪耻之日焉？愿陛下圣意果断，戒之，慎之。”言罢，再拜，而后端坐受刑。
隆武帝与忠于他的大臣，在抗清上的布局，亦被清廷所发觉，时任清廷江西提督的金声恒，便非常害怕，赶紧上书多尔衮道：“主子细观南明陈兵之势，仿佛一常山之蛇，以浙东为首，江西为腹，湖南、广西、云贵为尾，敌害怕江南满洲，故于东南取守势，而乘主子江西兵力之单弱，意欲夺路而出，以震惊江宁，再者何腾蛟与广东王彦相连，拥重兵于上游，若此二人携雄师，以上攻陷，夺武昌，下九江，则江西不保，东南半壁亦一鼓而复矣。主子恳请皇父摄政王，发真满洲兵两万，与主子合兵一处，由赣南直捣闽广，斩其腰腹，使敌首尾不能相顾，则钱塘可一苇而渡，而后合力安定云贵，一统之业岂不易易哉！”
明清两边都熟谙到江西在计谋上的职位，但隆武帝却没法变更郑芝龙的军队进入江西，万元吉入赣以后，也因为清廷总督江南的大臣洪承畴抽调柯永胜、高进库等部进入江西同金声恒部协同作战，雄师直压吉安，而疲于应对，底子没有才气迎隆武帝出闽。
福都城内，天子为赣南逐步恶化的局势而忧心忡忡，几次训令下，郑芝龙不得不派永胜侯郑彩出衫关，援救江西明军，但郑彩到底衫关以后，却再次按兵不动，不管监军给事中张家玉如何催促，他一概置之不睬。
时清廷派使洪承畴劝降，黄道周又写下如许一副春联：“史笔流芳，虽未胜利终可法；洪恩浩大，不能报国反成仇。”将史可法与洪承畴对比。洪承畴又羞又愧，上疏要求免道周极刑，清廷不准。
被王彦留在福京的王威，瞥见黄道周部下的兵将，多数是应募而来，贫乏作战经历，而黄道周本人也是个手无缚鸡之力的文臣，只是临时看了一些兵法，却向来没有批示过军队的经历。
王威久在军中，又随王彦与清军比武，只道清兵的短长，而黄道周部下的兵马，明显不成能克服清军，因而他在送别黄道周的时候，向他建议，斥慢慢队，只带少数精锐，由巷子直接进入赣州，以大学士督师的名义，节制和变更湖广、西南等地的总督、巡抚、总兵，会师进取。
观刑百姓无不痛哭流涕，大喊，“黄大人。”
只是黄道周却舍不到手上的三千兵马，以为有总比没有好，便没有采取王威的建议。
王威见此，心中无法，只得从忠义营中调拨精兵五百，让为首的百户，千万护住阁老全面。
黄道周随勉强奏够三千多名流卒，与兵部职方司主事赵士超，一起踏上征途。
随后清军将黄道周押送至南京狱中，他在狱中吟咏仍旧，有诗云，“六十年来事已非，翻翻复复少朝气。老臣挤尽一腔血，会看中原万里归。”
张家玉心中气愤非常，只得上疏弹劾，隆武帝也只能无法的再一次消去郑彩的爵位。
兵部右侍郎兼右副都御史万元吉知陛下情意，随上疏密奏，“赣州居上游，豫章不能抬头而攻，且左为楚，右为闽、浙，背为东粤，足以节制三面，宜驻跸也。”
大学士黄道周对此不堪气愤，随于首席大学士左懋第商讨以后，决定由左懋第持续留在福京帮手天子，而他则自告奋勇的请命督兵出福建，援助江西，并联络困于徽州大山当中的江天一部义兵，设法为朝廷翻残局面。