战后，联盟为捐躯的兵士们停止了昌大的悲悼典礼。艾莉丝站在记念碑前，心中充满了对战友们的思念和对将来的任务。她晓得，宇宙的战役仍然脆弱，联盟另有很长的路要走。但她坚信，只要各文明连合一心，仰仗着聪明和勇气，必然能够克服将来的统统应战，保护这片浩大宇宙的安宁与繁华……
但是，联军在绝望之际，启动了他们的终究兵器——一颗颠末改装的能量炸弹，其包含的能量足以摧毁全部星系。联军诡计通过同归于尽的体例来毁灭联盟舰队。
艾莉丝、卡修斯和瑞克斯再次投身战役，他们作为舰队的前锋，带领着各文明的精锐战舰，朝着联军能够埋没的星系进发。一起上，舰队遭受了联军的多次小范围攻击，但都仰仗着高超的战术和固执的意志胜利击退仇敌。
被击退的内部权势并未善罢甘休，他们结合其他星际强盗权势，构成了一支更增强大且隐蔽的联军，在宇宙的暗处策划着春联盟的致命一击。同时，联盟内部因新能量好处分派产生的纤细冲突，也被一些别有用心的权势暗中煽动，虽未激发大范围抵触，却在各文明间埋下了不信赖的种子。
艾莉丝决定将计就计，让队员假装成暗盘构造成员，混入联军内部。在一次联军与暗盘构造的买卖中，他们胜利打入了联军的核心基地。基地内部防备森严，到处都是先进的防备设施和巡查兵士。艾莉丝等人操纵隐形装配和高超的潜行技能，逐步靠近能量研讨地区。
在狠恶的战役中，瑞克斯带领着一支突击队，胜利冲破了联军的防地，登上了一艘联军旗舰。他们在舰内与仇敌展开了近身搏斗，颠末一番苦战，胜利摧毁了旗舰的批示体系，使联兵舰队堕入了混乱。
艾莉丝在联盟总部的科研中间，带领团队进一步深化新能量的研讨与利用拓展。他们试图将新能量与生物科技连络，开辟出能够加强生命体潜能的技术，但尝试停顿迟缓，且呈现了一些难以解释的非常征象。尝试样本在接管能量刺激后，基因呈现了不稳定的变异，部分乃至产生了狂暴且具有进犯性的行动偏向，这让艾莉丝深感忧愁。
终究，在颠末一番存亡斗争后，他们胜利冲破了防备场，靠近了能量炸弹。艾莉丝和队员们操纵飞船上的统统兵器和能量装配，对能量炸弹策动了进犯。颠末持续不竭的进犯，能量炸弹的布局开端呈现不稳定迹象。
卡修斯则驾驶着一艘颠末特别改装的战舰，仰仗着超卓的操控技术，在联兵舰队中穿越自如，精准地进犯着联军的关头战舰，极大地减弱了联军的战役力。
此时，联盟边疆的一些小型哨站俄然落空联络。联盟议会告急调派窥伺舰队前去调查，却发明这些哨站蒙受了不明权势的攻击，现场一片狼籍，残留的能量颠簸显现进犯兵器包含着与联盟新能量类似但又更加扭曲的力量。艾莉丝接到动静后，认识到这能够是内部联军的摸干脆进犯，他们不知通过何种手腕获得了新能量的部分离艺，并停止了险恶改革。
艾莉丝在联盟舰队的批示舰上，密切存眷着疆场局势，不竭调剂战术。跟着战役的停止，联盟舰队逐步窜改结局势，联军的战舰一艘艘被摧毁或落空战役力。
宇宙文明联盟仰仗新能量技术兴旺生长，星际飞行更加便利高效，各星球间的交换与合作日趋频繁，文明、科技、经济相互融会，一片繁华气象。但安静之下，暗潮涌动。
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