正如皇太极所料，袁崇焕乞降的心机是火急的，他深知上一年向崇祯许下的“5年复辽”不过是一张空头支票，胡想通过跟皇太极和谈，诱使后金退还已被攻占的辽东。颠末皇太极与袁崇焕之间，信使的多次来回，公开或奥妙的几度和谈，皇太极“佯许还辽”，“使杀文龙”，终究获得袁崇焕的“答书密允”，袁崇焕萌动了对毛文龙的杀机。明崇祯二年（1629年，后金天聪三年）六月，袁崇焕借前去辽阳火线观察之机，亲率一支由海员和甲士构成的小分队，渡海来到毛文龙地点的海岛营寨，他以慰劳为名向毛文龙的部众发放了10万两饷银，并在毛文龙的伴随下检阅军队和颁发发言。很多听者都被袁崇焕慷慨激昂的演说打动了，讲台下一片涕零声。俄然袁崇焕的话锋一转，面向站在身边的毛文龙列举了12项该问斩的罪行，随即对环列本身摆布的亲兵一声大喝：“还不给我脱手！”一名手捧崇祯所赐尚方宝剑的魁伟甲士，乘毛文龙正惊诧不备，挥剑将他斩于阅兵台前。崇祯帝在接到袁崇焕斩毛文龙的奏报后，非常震惊，但事已至此，又恰是要用他抵当后金的时候，只好对他先斩后奏的行动表示附和，不过在内心里却今后对这位袁大将军产生了疑忌，因为当时的京师正哄传一种流言：毛文龙体味袁崇焕同皇太极很多和谈奥妙，毛文龙的被斩同袁崇焕杀人灭口有联络。
据清廷秘传:努尔哈赤小福晋德因泽向天命汗告密大福晋两次备好菜送给大贝勒，大贝勒受而食之；又送给四贝勒，四贝勒受而未食。大福晋常常派人去大贝勒家，还在深夜外出宫院。努尔哈赤派人调查失实。因为惊骇家丑传扬，便借端惩办大福晋。这件事在满洲贵族中暴光后，大贝勒代善的声望大降，已有力图夺汗位。有学者说小福晋德因泽告密是遭到皇太极的教唆，皇太极藉大福晋同大贝勒代善难以说清道明的“隐私”，施一箭双雕之计：既使大贝勒申明狼籍，又使大福晋遭到惩办。大福晋在此次事件中受了点“伤”，但没有“死”，不久又重获努尔哈赤的宠嬖。
毛文龙是明末杭州籍的抗金将领，原是明东北边将李成梁的部下，后在广宁巡抚王化贞部下担负军职。后金努尔哈赤攻占辽东时，他下海占有了辽东本地岛屿，从逃散的辽民当选招数万兵士，多次攻击后金火线，为明朝立下汗马功绩，对后金军的西进、南下，起到了必然的管束作用。而后金兵士不习海战，加上渡海船只贫乏，对毛文龙部则无可何如。是以明朝天子很看重毛文龙，一再封赏提职，官居总兵却挂将军印。对这些皇太极一一看在眼里，忧在心头。至于袁崇焕，皇太极当然记得父亲发兵以来，初次受重创是在袁崇焕死守的宁远城；本身即汗位后，率雄师进军辽西，宁远、锦州之战，后金军威受挫，就是因为面前耸峙着一个袁崇焕。皇太极心中对毛文龙和袁崇焕的悔恨，达到了咬牙切齿境地，颠末几次思虑，一个“借刀杀人”巧除敌手的构思，很快在皇太极脑筋中构成。