鼠疫产生之初，当局为死者供应棺材安葬他们；在街上发明的尸身也由当局出面汇集，放在棺木运到坟场。到了前期，当灭亡人数越来越多时，尸身也便被直接放在坟场。跟着气候渐冷，地盘被冻得坚固，不要说深挖洞，就是想挖一个浅坑，都非常困难。以是这些尸身也都被随便弃之于坟场空中上，已经起码6周不足。伍连德重视到，这些尸身各种姿式都有，有的乃至还保持着坐姿，这大抵是因为在病笃之即就被家人扔出来，而他们在极度酷寒的气候里做了最后取暖的尽力。当时的防化营的张天德营长忧心这个坟场会变成一个庞大的鼠疫杆菌的大冰柜。如果有老鼠或其他植物打仗到这些尸身，再由植物感染给城里的人，那么统统防疫办法都将化为乌有。
颠末谈判，日本节制的南满铁路于共和二年1月14日停驶，俄国节制的东清铁路，其2、三等车于1月19日停票，甲等车采纳检疫体例。东北境内的交通根基停顿下来。山海关是从东北进入关内的必经之路，1月13日北洋北京当局还在山海关设立查验所，凡是经此南下的搭客都要在此逗留5天予以察看。这些办法是如此峻厉、如此完整，乃至于熊秉三和汤化龙两人从东北安排救灾返回时，也毫无例外埠在山海关逗留5今后才得以返京。
当时，俄国防疫部分的相干人士也在旁旁观了具有汗青性的焚尸过程。厥后他们也效仿中方的做法，把俄国人辖区内染疫尸身，不管是新近死去的还是已经腐臭的，全数火化。2月间，俄方共焚化了1416具尸身，此中1002具尸身是从宅兆中掘出来的。
当时的哈尔滨，是天下上最大的大豆集散地和买卖市场。这里堆积了多量从山东和直隶两省进入东北的劳工。除了浅显劳动力外，数以千计的小商贩也随季候窜改，向北挪动。固然对这部分流动听口并没有一个切确的统计数据，但10万人并不是一个被高估的数字。当时正值年关，遵循中国人传统看法，他们必必要千方百计回籍过年，这些庞大的人群中，必定包含为数很多的鼠疫传染者。一旦大范围的春节返乡潮开端，瘟疫必将会传播到关内。
当时也没有尝试室，伍连德和助手就在本地总商会借了一个房间，做血液化验。将样本牢固掉队行构造切片查验。在贝克显微镜下，伍连德清楚地看到了一种椭圆形的疫菌――恰是鼠疫。伍连德当即向北京外务部发去电文，陈述此事，并且提出开端的防疫办法：节制铁路、公路交通，以防瘟疫伸展；断绝疫区傅家甸；向关内征聘大夫等。
达到哈尔滨的第三天，伍连德得知傅家甸一名与本地人通婚的日本女人死于瘟疫，他决定解剖尸身。
“张天德仰仗直觉，感受鼠病菌在空中下也是能够存活的，但是他当时并没偶然候去做尝试证明这一点。厥后俄罗斯专家公然证了然这一点――在哈尔滨隆冬的极低的温度下，肺鼠疫的病菌起码能存活3个月。”后代的研讨也证明了这一点。
伍连德发明，这一次产生的疫情明显与以往对鼠疫的认知有很多抵触。初到哈尔滨时，姚大夫也向他坦陈了他的察看：傅家甸民居低矮肮脏，夏季门窗紧闭氛围不畅通，室内一人抱病很快即传染百口――他以为这类病是在人与人之间通过飞沫和呼吸传播的急性肺部炎症。在伍连德达到哈尔滨前，日本南满铁路也派了一名日本大夫前来调查病因，这名日本大夫是北里柴三郎的门生，他一到哈尔滨，就当即雇人捉老鼠，但愿在老鼠身上发明*鼠疫杆菌。连续解剖了几百只，却没有发明一例带鼠疫菌的。基于各种事例，伍连德大胆提出，在傅家甸风行的鼠疫无需通过植物媒介，而能够通过呼吸之间的飞沫感染，他将此定名为“肺鼠疫”。