当局军从17日起，为打通进入熊本城的通路，持续四天猛攻熊本东门，并以80门大炮支撑，势在必得，成果被筱原国干所部逐次击退。21日，当局军再度集结猛攻，并由俄军出动哥萨克马队千余人包抄，血战近五小时，终因城门内棉花堆栈起火，东门陷于敌手，筱原国干率军退守堤头。此役萨摩军监军伊东直二阵亡，筱原国干所部伤亡3000余人，保卫东门的萨摩军官兵几近全数阵亡于阵地之上。当局军伤亡近5000余人，门路上叠尸重重，人马几不能行进。
当局军打击东门时，亦别离进犯光亮寺、有马台、胜古神社一带，别离遭别府晋介、西乡小兵卫部击退。22日，林逸青又率奇兵队在南门击退了当局军的打击。至此，萨摩军已与当局军血战12日，据外人记录：“萨兵虽少，皆搏命向敌而战，最可畏者，林逸青所部奇兵队耳；盖林军有进无退，每为各军之先，虽受枪炮，前者毙，后者又进，其猛处诚有非他军所可对比者。”
当局军从南门入城后，便北上共同城东北的当局军夹攻城内的萨摩军主炮台。炮台守军虽腹背受敌，仍英勇作战，在毙伤当局军千余人名后撤离并引爆了预先埋设的火药，完整炸毁了炮台，攻上炮台的当局军兵士全数被炸身亡。(未完待续。。)
以后当局军调剂了摆设，主力开端向北挪动。第四旅团向山鹿方面进发，第一旅团向田原坂方面进发，第二旅团以落第六第七结合旅团向木留进发，第三旅团则卖力守备海岸线。留下围城的军队由第五旅团新任旅团长山田显义少将批示，兵力为第2、3、4、5、七旅团的一部以及协同队等，总计十六个大队，总数约30000人。
10月1日，当局军救兵12000人重新策动打击，并在城门外架炮向城内轰击。林逸青再次亲身率兵夜袭。当局军撤退。第二天。山县有朋不顾伤亡又一次策动打击。又被击退。
23日，当局军救兵 21000余人在山县有朋的带领下进抵熊本。野津道贯随即召开军事集会，决定持续强攻熊本。会中将熊本战区重新分派，野津道贯军卖力熊本西、北、南三面，以南面为主；山县有朋军卖力东面，并禁止长崎方向前来的萨摩军救兵。
从10月2日至4日，交兵两边几近每天都构造数千人范围的打击，战役相称狠恶，在日本当局军的狠恶打击陷，萨摩军因兵力军器不敷，垂垂处于下风。10月5日那天，当局军第五次猛攻北门，将北门攻破。在东门，当局军于10月5日晚以死囚构成的敢死队数百报酬前驱，踩爆萨摩军埋设的地雷，一度冲进了东门。守军奋力抵当，内城的住民也操纵暗夜打冷枪、发射火箭、以刀剑砍杀敌兵，主动共同萨摩军打击仇敌，但到天明时，东门终究沦陷，守军全数阵亡。当局军开端从东门和北门一拥而入，同萨摩军展开巷战。
10月8日夜，界河东岸的当局军向北打击，9日拂晓炮击萨摩军贵岛清等部阵地。10日上午7时摆布，当局军炮击熊本城东南壕墙外的火药库，引发了狠恶的爆炸。当局军乘机强攻萨摩军各阵地，并向萨摩军炮台打击。至13日中午12时，萨摩军被迫撤出各阵地，纷繁向南郊败退，当局军乘胜进抵东南城下。界河西岸的当局军于13日凌晨出城南面土墙，经光亮寺向熊本城南门进逼，炮兵则在城南面壕墙上炮击熊本城区。南门表里萨摩军抖擞抵当，西门四周的萨摩军炮兵开炮轰击光亮寺四周的当局军。此前，城门外住民已挖开河堤，使当局军被阻于光亮寺四周一带，颠末商讨，当局军批示官决定架桥强攻。