是年，安南入贡。
夏四月乙未，免湖广、四川逋赋。丙午，诏户部岁增金花银二十万两。
是年，乌斯藏入贡。
冬十月辛丑，汰表里冗官。乙巳，振苏、松、常、镇饥。
是年，琉球入贡。
是年，暹罗、琉球入贡。
秋七月，河决徐州。
■九年春正月庚午，敕边臣备警。辛未，裁诸司冗官。癸酉，土蛮犯锦州，游击周之望败没。己卯，命翰林官日四人入直。辛巳，裁南京冗官。甲申，辽东总兵官李成梁袭败土蛮于袄郎兔。
秋七月，江北蝗，江南大水，山西、陕西、河南、山东旱，河决开封，蠲振有差。
十仲春甲午，以宁夏贼平，告天下。是年，暹罗、土鲁番入贡。
夏四月丙午，大雩。戊申，以旱诏中外理冤抑，释凤阳轻犯及监禁年久罪宗。戊午，步祷于南郊，面谕大学士等曰：“天旱虽由朕不德，亦天下有司贪婪，剥害小民，乃至上干天和，此后宜慎选有司。”蠲天下被灾田租一年。
六月己卯，免畿内被灾夏税。甲申，青海部长火落赤犯旧洮州，副总兵李联芳败没。乙酉，更定宗藩事例，始听无爵者得自便。
秋八月壬寅，严匿名揭之禁。
冬十月壬寅，李如松提督蓟、辽、保定、山东军务，充防海御倭总兵官，救朝鲜。是月，振畿内、浙江、河南被灾诸府蠲租有差。
六月己酉，雷雨，西华门灾。敕修省。
夏四月甲申，振湖广饥。
十仲春辛酉，振榆林、延绥饥。甲戌，以大行未期，罢来岁元夕灯火及宫中宴。
秋七月乙卯，吕调阳致仕。丙子，诏江北诸府民，年十五以上无田者，官给牛一头、田五十亩开垦，三年后起科。
玄月乙未，杨方亨至日本，平秀吉不受封，复侵朝鲜。乙卯，葬孝安庄皇后。是月，河套部犯宁夏。总兵官李如柏击败之。是秋，河决黄堌口。
仲春戊寅，祀大社大稷。辛巳，诏南京职务清简，官不必备。丙申，始命日讲官分直记注起居，纂缉章奏，临朝侍班。
三月丙申，诏表里官举将材。
八月己巳，振山西灾。庚午，振淮、扬、徐水患。
夏四月丁酉，振山西被灾州县。乙卯，振苏、松、淮、凤、徐、宿灾。户部进《万历管帐录》。
六月戊辰，禁廷臣奢僭。是月，京师大雨。振恤穷户。
■六年蒲月，穆宗崩。
冬十月丙子，停刑。乙酉，始射中官榷税通州。是后，各省皆设税使。群臣屡谏不听。
冬十月丙寅，礼部主事卢洪春以疏请谨疾，杖阙下，削籍。
秋玄月戊寅，青海部长永邵卜犯甘肃，参将达云败之。乙酉，诏复建文年号。
秋七月丙申，河套部长失兔犯延绥。是月，延绥总兵官麻贵败河套部敌于上马关。
■十七年春正月己酉朔，日有食之。丁巳，太湖、宿、松贼刘汝国等反叛，安庆批示陈越讨之，败死。
十一月戊辰，御午门，受宁夏俘。
三月甲子，免淮、扬逋赋。
三月戊辰，宁夏致仕副总兵哱拜杀巡抚都御史党馨、副使石继芳，据城反。辛未，王家屏致仕。壬申，总督军务兵部尚书魏学曾讨宁夏贼。戊寅，赐翁正春等进士落第、出身有差。
闰十仲春庚寅，诏罢来岁元夕灯火。
■二十四年春仲春戊申，麻贵袭河套部，败之。
十一月癸卯，祀天于南郊。
是夏，苏、松、常、镇大水。
十一月丙子，诏度民田。
是年，哈密、琉球、乌斯藏入贡。
■十八年春正月甲辰朔，召见大学士申时行即是毓德宫，出皇宗子见之。
冬十月甲寅，决囚。丁卯，视朝阅铨选。
十一月乙巳，祀天于南郊。