琼崖的事情告一段掉队，张鹏飞便即回师。此次出兵固然未能完整剿除石壁，但也授予其沉重打击，信赖在短期内其不会再出来兴风作浪了。
从琼崖返来一个月后，万山岛迎来了一场丧事，张鹏飞终究和叶小慧喜结良缘。
厥后张鹏飞采取王天漠的建议，捏造公文假传沈犹龙的号令，宣称南头参将王彦充勾搭广州总兵宋纪等人造反，命令大鹏所军平叛，大鹏官兵并不完整信赖，但一方面他们对张鹏飞的遭受非常气愤，另一方面他们大多数人的身家性命已经被绑上张鹏飞的战车没法摆脱，便服从了张鹏飞的号令，只要张择善等少数军官反对出兵，但旋即被张鹏飞囚禁起来。
因而张鹏飞尽发大鹏所军水陆二营战役海营，加上南海数十座鱼厂、工厂的工人管事，外加疍民、艇民，另有臣服于张鹏飞的海盗，总计水陆雄师三万余人起兵，兵分两路对南头大营和广州城同时建议打击。
张鹏飞进入广州城严明军纪，大鹏所军秋毫无犯，张鹏飞又广贴安民布告并开仓放粮以争夺民气，广州府的局势很快便稳定下来。
关头时候王天漠自告奋勇充当说客前去郑军大营，说之以鹬蚌相争渔翁得利的事理，郑芝龙也怕和张鹏飞硬拼丧失惨痛，反而被朝廷兔死狗烹，因而出工不着力。
在酒宴中，郑廷球以犒赏为名，设下伏兵擒获渤尼国王和大臣、贵族数百人，并杀死渤尼**民上万人，而后海盗们放出渤尼王子，以其为傀儡统治渤尼国，而郑廷球等海盗便占有渤尼王宫作威作福，并大肆搜刮金银财宝。
合法南海剿匪告一段落之时，远在粤北的猺民之乱却愈演愈烈，连山知县朱若迄惊骇万分，前后四次上疏朝廷，请兵剿瑶。崇祯十四年蒲月，明天子命两广总督沈犹龙、总兵施王政等，集结楚、豫、闽各省兵合剿八排瑶。而瑶民毫不害怕，英勇抗击官兵。至次年仲春，官兵剿瑶不克，反而被义兵斩杀了号称“勇猛善战”的广州副总兵陈鹏、守备黎树绩等头子和多量“敢死士”。
郑廷球逃回蜈蜞屿，走投无路。智囊王天漠向其献计，让海盗扮作明朝使臣前去突袭渤尼国。
张鹏飞依托座船的强大火力杀出重围，回到万山岛，他发明副千户康伯冲父子带着一帮人拿着广东都司的军令诡计篡夺兵权，便变更亲信粉碎了其诡计，当场砍杀康伯冲父子，又变更军队节制了万山岛、三门岛、大鹏所城等计谋要地。
在此期间，张鹏飞部下的邓让诡计刺杀张鹏飞，却被早有防备的张鹏飞擒获，本来这邓让真名叫郑让，倒是郑廷球的亲弟弟。
现在张鹏飞阵容如日中天，这引发了广州军政两方中很多人妒忌和发急，他们勾搭在一起，以南头参将王彦充为首，在南头大营设下鸿门宴，并以南海卫批示使陈奉先的名义聘请张鹏飞前去赴宴，并在席间伏下刀斧手诡计斩杀张鹏飞。
在大鹏所军的狠恶守势下南头大营才抵当半天便告沦陷，防备空虚且毫无防备的广州城也很快落入张鹏飞手中，城中的大小官员束手就擒，数今后，广州府南部的统统州县全被大鹏所军节制。两广总督沈犹龙欲要他杀却被青衣社打入其身边的特工禁止，也做了张鹏飞的阶下囚。
此时张鹏飞率船队来到蜈蜞屿，渤尼王子获得动静假扮渔民上岛向明军求援，因而大鹏所军在王子的带路下于夜晚奇袭渤尼王宫，击溃海盗并救出国王等人。郑廷球带着财宝落荒而逃，被张鹏飞设伏兵擒获。
而后数月张鹏飞又剿除数股海盗，兵锋直指猫岛的徐贵相，而这时两广本地的小股海盗纷繁前去蜈蜞屿投奔郑廷球，郑廷球顺势召开三十六岛联盟集会，完成了南海海盗的整合，也带领海盗船队来到猫岛援助徐贵相，两边展开一场大战，最后大鹏水营依托强大的火力击溃海盗船队，击杀和俘获了海盗头子数十名，郑廷球率海盗残兵落荒而逃。