刘仁轨见到了他上表的文稿。为他点窜了几个字，任瑰非常惊奇。见刘仁轨很有文明涵养，就以赤牒体例让他当上了息州参军（赤牒授官是唐初轨制。
按普通法度，应是吏部先用赤笔注官之状，门下省审批，天子最后授旨）。不久，刘仁轨又调任陈仓尉。本地有一个折冲校尉名叫鲁宁，
唐太宗但愿对他网开一面，群臣都说，“侯君集大逆不道，应当用国法措置他”。
刘仁轨把他抓了起来，让人拿棒子把他活活打死。动静上报到大唐天子李世民那边，顿时让天子勃然大怒，“一个小小的县尉，竟敢杖杀我的折冲，的确是没法无天”。
刘仁轨
唐高宗并非昏君，以为源直心言之有理，就将刘仁轨去官夺职，让刘仁轨以白衣身份随军效力。此时，朝鲜半岛的情势风云变幻，给刘仁轨供应了一个绝好的机遇。
如果等百姓收割结束，皇上再行射猎，于公于私，都能兼顾”，唐太宗知错必改，将打猎行动推迟了整整一个月，他下旨表扬了刘仁轨的谏言，“你固然官职不高，却竭诚为民，所陈之事，甚得君心”。
中书侍郎岑文本挺身而出，为侯君集作了出色的辩白。他列举了陈汤等前朝大将的故事，但愿唐太宗记人之功，忘人之过，并援引黄石公兵法作为论据，
终究未能将李义府科罪，打狼不成，反被狼咬，今后李义府将刘仁轨恨得咬牙切齿，显庆五年(公元660年)，李义府落井下石的机遇终究来到了。
但是他从未放弃本身。没有纸笔，就用树枝在地上写字练习，竟然读通了文史。以博学闻名。武德初，河南道大使、管国公任瑰筹办上表论事，
在袁异式解缆之前，李义府就打了号召，“君能办事，不忧无官”，袁异式心领神会，决计对刘仁轨倒霉。
军法曰：“使智、使勇、使贪、使愚，故智者乐立其功，勇者好行其志，贪者邀趋其利，愚者不计其死”，以是之前的明君用人，必定用人所长、弃人所短，不会等闲委曲功臣大将。唐太－□，宗深觉得然，下诏开释侯君集，不再究查他的不对。
因为这能极大地进步军队的战役力，但是御史大人们并不这么以为，他们接连对侯君集停止了峻厉的弹劾，率部返来的侯君集很快被下了大狱。
不久，刘仁轨晋升为新安(今属河南)令，累迁到给事中的位置。隋唐之时，给事中成为门下省的属官，
却远远没有满足他所希冀的要求。俗话说，繁华险中求，他要在皇太子李承乾的身上找到登峰造极的繁华。
张亮答复道，“还不是你背后架空我”，侯君集积怨难消，“我平灭高昌。返来就被天子下狱，哪有机遇背后架空你，这类日子过得实在愁闷。
我过不下去了，你敢造反吗。我们一起反了吧”。张亮心中惊骇，转头就将此话奉告了李世民。李世民以为这只是侯君集一时的气话，按下此事，
唐高宗龙朔元年(公元661年)，左卫中郎将王文度被任命为熊津(今韩国公州)都督，
侯君集临刑前，神采平静，他请监斩官转告唐太宗，留下一个儿子持续侯家的香火（谋反本是满门抄斩），唐太宗承诺了他的要求，赦免了他的老婆和一个儿子，将他们放逐岭南。
李义府晓得刘仁轨一贯的办事风格，晓得本身不能心存幸运，他很快逼迫毕公理在狱中他杀身亡。刘仁轨固然秉公办事，苦于没有相干人证，
恰好拉他一同入伙。侯君集的半子贺兰楚石当时是东宫属官，为两人见面牵线搭桥，他们多次在一起策划政变。侯君集曾举手对李承乾言道，“此手当为殿下用之”。