蚩尤秉承着神农的复仇，带领兽族向人类开战，企图独占大地。伏羲和女娲联手，因此人类获得神族援手，对抗兽族。伏羲推演八卦，已算到这个天下已经被其他贤人晓得，晓得这块蛋糕本身和女娲二人独吞不下。便又请来三皇之三的黄帝轩辕。轩辕投出神念，转生神族，便又是一个轩辕氏。
天下窜改，沧海桑田。人类有聪明之助，昌隆起来，生长出封建文明。到了夏朝之时，因为神界地气异变，神树爆长万丈，根系如垂天之云，深切盘古之心，盘古之心辐聚周边土石，逐步扩大，构成悬空之山，是为“蜀山”。
总让他逮到了机遇，导致三皇之一的神农兼顾在人间暴毙。后代传说，神农因尝百草中毒而死，另说是因为他与兽交合繁育后代而死。实在都不精确，但是谁又能想获获咎魁祸首，是三皇之首的伏羲呢？
而后，在神界的帮忙下，梁武帝之佛塔改建成锁妖塔。蜀山剑仙自此根基上以蜀山仙剑派为支流，修炼体例重视内功和剑术，修仙求积善而不求升仙，主动出世斩妖。同时，也不架空其他门派的修炼体例，主动汇集和保存各种修仙体例。