在抵抗之初，日本也不甘逞强，日本公使林助权逼迫外务部会同粤督袁树勋严禁粤商抵抗日货。但抵抗日货运持续扩大，日本驻京代理公使阿部守太郎又向清廷外务部“抗议”，还要求清廷索偿“二辰丸”案赔款二十一万元。
相反，清廷在本国的恐吓下，一再让步，不但自招其辱，还引发国人的激烈不满。
固然陈文强的要求并没有被张之洞全数承诺，但财产搬家调剂，再加上张之洞也赐与了尽能够的照顾，陈文强在湖南的权势算是安定了。不但仅是拿到了巡警道一职，另有劝业道、湘省戒备军总办、湘省铁路督办、湘省厘金局总办，再加上湖广新军编练处帮办，也算是位多权重了。
而“二辰丸”号案件，可不但仅是查获私运船那么简朴。对日本的在理威胁全数照办，除了触及到国度颜面、民族自负外，还留下了更大的隐患，那就是澳门的划界题目。如果“二辰丸”案件的措置成果让日本人快意，那便是变相地承认了所处海疆、地区〖〖〖〖，是属于澳门，所领本地权是属于葡萄牙。