《剑桥中国明朝史》称：“他（崇祯天子）信赖了谎言，于1630年9月22日在北京杀了他最有才气的将领袁崇焕。”
天启七年（1627年），明熹宗驾崩，明思宗朱由检即位，设想将魏忠贤撤除，并把之前冒领军功的人削职。在朝中大臣的建议下，袁崇焕得以重新被启用，被任命为兵部尚书兼任右副都御史，督师蓟辽、兼督登莱、天津军务。同年七月，袁崇焕返回都城，上疏陈述兵事，朱由检于平台召见袁崇焕，袁崇焕宣称本身能够五年复辽，朱由检对此大加赞美。给事中许誉卿问袁崇焕复辽的战略，袁崇焕却说是用这类话安抚皇上。许誉卿说：“皇上贤明，怎麽能够随便应对。他日遵循刻日寻求效果，你该怎麽办？”袁崇焕也感觉本身讲错了，因而上奏说：“五年复辽的打算不轻易完成，陛下既然拜托给臣，臣怎麽敢推让这艰巨的任务。但是五年内，户部转运军饷，工部供应东西，吏部用人，兵部调兵选将，必须朝廷表里事事共同，才气有所胜利。”朱由检因而让四部的臣遵循袁崇焕的话办。[26]
崇祯二年（1629年），驻守宁远的来自于川、湖等地的兵士因为军饷的事而叛变，袁崇焕用计将其安定。而后袁崇焕要求将宁远、锦州合为一镇，让祖大寿镇守锦州，何可刚替代朱梅驻宁远，赵率教守关门，袁崇焕自驻宁远，同时上书给朱由检死力奖饰祖大寿等三人的才气，并说本身五年复辽的打算端赖这三人来实现，如果五年后没有实现，他将亲手将这三人斩杀，本身到司法部分领罪服死。朱由检加封袁崇焕为太子太保，并赐给蟒衣银币。[28]
袁崇焕因为行事风格的题目，曾经让正视他的孙承宗大为大怒，[65]擒杀毛文龙也是袁崇焕私行主张。他的同事王在晋以为袁崇焕固然死于国法，但是他的功绩不成淹没，[66]但同时，他也以为袁崇焕的死是自取灭亡。[67]
但后金军退兵后，袁崇焕却被定罪。当初后金军进入的关隘是属于蓟辽总理刘策所统领，而袁崇焕得知后金军入关，直逼都城，因而千里迢迢赶来救济，自以为有功无罪，但是朝中大臣却有很多人以为是袁崇焕放清兵入关，因而纷繁诽谤袁崇焕与后金军有勾搭，朱由检对此也很思疑。此时后金军也设想诽谤，说袁崇焕与后金军有奥妙商定。十仲春，朱由检将袁崇焕下狱。[39]
而后袁崇焕聘请毛文龙旁观将士射箭，预先在山上设置好帐篷，令参将谢尚政等率兵埋伏在帐外。毛文龙到了以后，他的部下没能入内。袁崇焕说：“我凌晨就走，你担负外洋的重托，请受我一拜。”毛文龙回拜以后俩人开端登山。路上袁崇焕问侍从官员的姓名，大多都是姓毛的。毛文龙说：“这些都是我的孙子。”袁崇焕笑着说：“你们在外洋悠长劳累，每月禄米只要一斛，说来痛心，也受我一拜，请为国度极力。”世人都叩首伸谢。[31]
清乾隆天子感觉袁崇焕的死值得怜悯，民国初年，梁启超在《袁崇焕传》中对袁崇焕大加赞美，以为他是能影响国度安危、民族兴亡的人。1952年，北京市停止大范围的改革都会扶植时，叶恭绰等联名上□□，要求庇护袁墓，□□在答复中称袁崇焕为“明末爱国魁首”。
崇祯二年（1629年）十一月，后金主皇太极举兵数十万别离进入龙井关、大安口，袁崇焕听闻后带领祖大寿、何可刚入关保卫，所颠末的蓟州、抚宁、永平、迁安、丰润、玉田各城，都分兵留守。天子朱由检得知后非常欢畅，命令嘉奖袁崇焕的部下，并让袁崇焕统领批示各地救兵。[34]