北匈奴遣使称臣进献，愿和亲，修呼韩邪故约。帝以其旧礼不备，未许；而厚加犒赏，不答其使。
冬，十月，戊申，帝幸章陵；戊午，进幸云梦。时太尉张禹留守，闻车驾当幸江陵，觉得不宜冒险远游，驿顿时谏。诏报曰：“祠谒既讫，当南礼大江；会得君奏，临汉回舆而旋。”十一月，甲申，还宫。
三月，戊辰，临辟雍飨射，赦天下。
南单于师子死，单于长之子檀立，为万氏尸逐韑单于。
迷唐复还赐支河曲，将兵向塞。护羌校尉周鲔与金城太守侯霸及诸郡兵、属国羌、胡合三万人出塞至允川。侯霸击破迷唐，种人崩溃，降者六千馀口，分徙汉阳、安宁、陇西。迷唐遂弱，远逾赐支河首，依发羌居。久之，病死，其子来降，户不满数十。
十一月，己丑，帝行幸缑氏，登百峛山。
清河王庆始敢求上母宋朱紫冢，帝许之，诏太官四时给祭具。庆垂涕曰：“生虽不获扶养，终得奉祭奠，私愿足矣！”欲求作祠堂，恐有自同恭怀梁后之嫌，遂不敢言，常泣向摆布，觉得没齿之恨。后上言：“外祖母王大哥，乞诣雒阳疗疾。”因而诏宋氏悉归京师，除庆舅衍、俊、盖、暹等皆为郎。
冬，十月，辛卯，以司空徐防为司徒，大鸿胪陈宠为司空。
永元十一年己亥，公元九九年夏，四月，丙寅，赦天下。
班超久在绝域，大哥思土，上书乞归曰：“臣不敢望到酒泉郡，但愿生入玉门关。谨遣子勇随安眠献物入塞，及臣生在，令勇目见中土。”朝廷久之未报，超妹曹大师上书曰：“蛮夷之性，悖逆侮老；而超旦暮上天，久不见代，恐开奸宄之源，生逆乱之心。而卿大夫咸怀统统，莫肯远虑，如有卒暴，超之力量不能从心，便为上损国度累世之功，下弃忠臣极力之用，诚可痛也！故超万里归诚，自陈苦急，延颈逾望，三年于今，未蒙省录。妾窃闻古者十五受兵，六十还之，亦有歇息，不任职也。故妾敢触死为超求哀，匄超馀年，一得生还，复见阙庭，使国度无劳远之虑，西域无匆急之忧，超得长蒙文王葬骨之恩，子方哀老之惠。”帝感其言，乃征超还。八月，超至洛阳，拜为射声校尉；玄月，卒。超之被征，以戊己校尉任尚代为都护。尚谓超曰：“君侯在本国三十馀年，而小人猥承君后，任重虑浅，宜有以诲之！”超曰：“大哥失智。君数当大位，岂班超所能及哉！必不得已，愿进愚言：塞外吏士，本非孝子顺孙，皆以罪恶徙补边屯；而蛮夷怀鸟兽之心，难养易败。今君性严急，水清无大鱼，察政不得下和，宜荡佚简易，宽小过，总纲领罢了。”超去，尚私谓所亲曰：“我以班君当有奇策，今所言，平平耳。”尚后竟失边和，如超所言。
十一月，癸卯，以大司农沛国徐防为司空。防上疏，觉得：“汉立博士十有四家，设甲乙之科以勉劝学者。伏见太学试博士弟子，皆以意说，不修家法，私相包庇，开生奸路。每有策试，辄兴诤讼，论议纷错，相互是非。孔子称‘述而不作’，又曰‘吾犹及史之阙文’。今不依章句，妄生穿凿，以遵师为非义，意说为得理，轻侮道术，浸以成俗，诚非圣旨实选本意。改薄从忠，三代常道；专精务本，儒学所先。臣觉得博士及甲乙策试，宜从其家章句，开五十难以试之，解释多者为上第，引文明者为高说。若不依先师，义有相伐，皆正觉得非。”上从之。
秋，玄月，辽东太守耿夔击高句骊，破之。冬，十仲春，辛未，帝崩于章德前殿。初，帝失皇子，前后十数，后生者辄隐蔽养于官方，群臣无知者。及帝崩，邓皇后乃收皇子于官方。宗子胜，有痼疾；少子隆，生始百馀日，迎立觉得皇太子，是夜，即天子位。尊皇后曰皇太后，太后临朝。是时新遭大忧，法禁未设，宫中亡大珠一箧；太后念欲考问，必有不辜，乃亲阅宫人，察看色彩，立即首服。又，和帝幸人吉成御者共枉吉成以巫蛊事，下掖庭考讯，辞证明白。太后以吉成先帝摆布，待之有恩，常平常无恶言，今反若此，分歧情面；更自呼见实核，果御者所为，莫不叹服觉得圣明。