但是，智觊大师的申述并非批评弟子杨广，杨广只是一个藩王，上有父皇和太子杨勇，不是杨广说了就算。而大一统的天下局势又要求认识形状的高度同一，同一政官僚求有呼应同一的宗教，建立为王朝所用的最高神学。杨坚在灭陈后不久就催促智觊要“以同朕心”，和朝廷保持分歧，智觊却不但不主动归依新朝，反而不肯“依违顺彼”，要“绝域远避”，“虽在人间，弗忘山野”，想自在地弘法布道，明显不容于当世，有悖于当时的政治情势。对于杨广来讲，他坐镇江都，受命统领旧陈之地，必定要做到江南的宗教思惟与朝廷的分歧，因为智智觊在江南宗教界的名誉，杨广不但要节制智觊，还想操纵智觊的影响力，就像拉拢操纵江南玄门首级王远知一样。王远知束手就范，但智觊却凛然不附。智觊的孤傲不平当然宝贵，而杨广对桀骜不驯的大师却也自始至终没有卤莽简朴地施之以毒害，而是很有耐烦地一次又一次地延屈，施之以惠，竭尽尽力地拉拢，但愿硬化智觊，使智觊戴德就范。
智觊先到金陵栖霞寺，后又来到江都城外禅众寺。厥后的行迹文献记录不详，但能够确知，他仍不肯住进慧日道场。对于智觊的刚强杨广仿佛无可何如，因而转而但愿大师传授佛法。六月二十一日和六月二十五日，杨广两次修书向智觊问禅法，杨广自称“仰逮还旨，犹乘谦尊，循复久之，仿佛自失，切以学贵承师，事推物论，历求法缘，厝心有在”。又说：“况居俗而俗兼善，当今数论法师无过此地，但恨不因禅发”。杨广执弟子礼甚恭谦虚请教看来目标是想成为露台智觊传灯的上首弟子，为此他又“复使柳顾言顿首虔拜”。“智觊频辞不免，乃着净名经疏”。七月，智觊以所着《净名义疏?初卷》馈送杨广，杨广“跪承宝贝，粗览纲宗”，但他进一步要智觊授禅传灯却遭到了决然回绝。
开皇十六年（596年）三月二旬日，智觊再主要求分开江都，他修书杨广曰：“露台既是寄终之地，以是恒思果遂，每嘱弟子，恐命不待期，一旦常身充禽鸟，燃烧余骨送往露台，愿得次生还栖山谷，求学成办乃可利人。”不日，智觊与杨广见面，劈面告别，“麾盖入谒，复许东归”。杨广诡计操纵智觊的政治图谋再一次落空了。
智觊临死时给杨广长长的遗书，对本身平生弘法作了总结，此中提到的“六恨”被以为是他遭到**的首要证据。遗书开首即云：
既再游江都，圣心熏法，令着《净名疏》，不揆暗识，辙述偏怀。玄义始竟，麾盖入谒，复许东归。而吴会之僧，咸欣听学。山间虚乏，不成聚众。束法待出，访求法门，暮年衰弱，许当野蛮，今出期既断，法门亦绝。字里行间充满痛切激愤之情，表达了一名殉道者对于世道不公的最后抗诉。
贫道初遇胜缘，发心之始，上期无生法忍，下求六根清净，三业殷勤，平生望获。不谓宿罪殃深，致诸留难，内无实德，外招虚誉。学徒强集，施主自来，既不能绝域远避，而复依违顺彼，自招恼乱，品德为亏，应得不得，忧悔何补。
智觊以沉痛的语气陈述本身削发弘法只求六根清净，想不到没法堵截尘凡的烦恼，他想远避绝域阔别政治而不成得，而不得不“依违顺彼”，他以为这是“上负三宝，下愧本心，此一恨也”。其第二恨为“再负先师百金之寄”。别的，他提到荆州法集被官司闭幕之事（五恨），和在江都被监督而没法布道之状（三恨），言辞暗含忧怨。大师又叹曰：“又作牵挂，此处无缘，余方或有，先因荆潭之愿，愿报地恩，大王弘慈，霈然垂许。于湘潭功德，粗展微心，虽法缘者众，孰堪委业？初谓缘者不来，今则往求不得，推想既谬，此四恨也”。在智觊看来，大隋一统天下仿佛没有他自在布道弘法之地。最后一恨他说：