阮元在都城多年，天然也晓得乾隆因为忌讳，在订正《四库全书》之时，对违碍词句，常常有所窜改（按：当代古籍清算出版，以古本为据，已是通识，只要全无古本可据，才会以《四库全书》本为据，故而当今风行的古籍版本，除非独一《四库》孤本，已不存在《四库》改字的题目。）。故而也非常怜悯邵晋涵，问道：“那……莫非先生便是因为此事，不肯再回都城了么？”
两日以后，阮元等人的大考成绩，升迁环境，翰林院一一公布。刘凤诰、胡长龄都列在二等，刘凤诰授侍读学士，胡长龄授侍讲学士，汪廷珍和刘镮之也在二等，只是名次略为靠后，别离授了五品侍读。那彦成列在三等，因满官缺多，也授了侍讲，只是卢荫溥因列在三等，乾隆便将他改部，做礼部主事去了。
阮元也毫不相让，道：“西庚兄，小弟此次得蒙皇上看重，实在忸捏，这酒钱天然是要出的。可西庚兄不也从六品的修撰，直升到四品的学士了吗？如果只让我出钱，你未免过分绝情。按我说，既然我们都是四品，那就一起出钱，如许才公允嘛！”
钱大昕道：“不错，你能有这番思考，足见你善心未泯。只是这天下……唉，已经不是老夫年青时阿谁天下了。老夫之言，或许你会感觉，是悖逆之言。可老夫心中，也总有些事不吐不快。伯元，你涉世未深，有些事，也是你应当晓得的。接下来老夫所言，或许已涉大逆，你可还情愿一听？若不肯意，老夫立即就走，毫不打搅你分毫。”
五个月后，因吴省兰升迁内阁学士，阮元被汲引为詹事，位列正三品，同时，阮元又加文渊阁直阁事、仪礼石经订正官二职。此时阮元只要二十八岁，而他从进士落第到升任詹事，只用了两年零六个月的时候。
不久以后，扬州也收到了阮元的来信，得知阮元超迁，阮承信和江彩天然大喜，连续庆贺了三日。只是想到阮元来信当中，提及俸禄已足家用，扣问江彩入京之事，阮承信和江彩还是有些踌躇不决。
世人见卢荫溥心境降落，想着毕竟翰林里有同门之谊，卢荫溥又比大家早入翰林，算是半个师长。并且他这一改部，以后再行饮宴便是难上加难，也一一站起，向卢荫溥敬酒。
这一日阮元收到扬州来信，言及江彩一行已经解缆，不日将到都城，自也欣喜。俄然听杨吉出去，道：“伯元，钱先生来了，看他模样，像是要离京了，说临走之前另有些话，想叮嘱你一番。”
“伯元，我来翰林这些年，也传闻翰詹升迁，不拘于常品，可一次从正七品升到正四品的，你不但是我见过的第一个，即便是我统统听闻的翰詹前辈里，也绝无你这般先例了！以是本日这顿酒钱，你就不要客气了，替大师出了吧！”他之前也因和府送礼一事，与阮元未几言语，可半年来那彦成四周驰驱为阮元讨情，刘镮之也把阮元改易笔迹一事奉告大师，他也就不再相疑，和阮元交好如初。
“可二云来信，却不但是为了请教，信的最后，提到如许一件事：皇上对这《旧五代史》编录，一向非常上心，故而二云早早手录一遍，献与了皇上。可没想过得几日，皇上诏二云前去，竟问起二云，为何金章宗之时，竟削去此书之位，仅列欧阴文忠公新史一书？二云一时不明其意，归家后细细看了，方知皇上意义。”
这一日翰林诸人也大摆宴席，相互庆贺高升。阮元列在第一，又授了少詹事，官职已是大家之首，故而胡长龄、那彦成等推了阮元坐首位。阮元推让再三，才勉强坐下。胡长龄看阮元高升，也不由笑道：
“可三十多年过来，皇上年纪大了，疑忌之心，也与日俱增，官方生员，多有因诗句中偶有一二违碍之处，便被揭暴露来，定了大逆的。乃至有些诗句，看来并无不通，却也有人穿凿附会，说是悖逆之言……皇上他清楚，老夫绝无犯上之心，故而老夫的事皇上从未过问。可这般寻章摘句，老夫……老夫也实在是心寒。想想二云勤于四库，本是为了存遗文于后代，不使先人之言埋没无闻，可实际倒是……老夫想到这里，归京之心也就淡了，以后守制期满，也只闲居家中，在江南各个书院讲学为乐，都城倒是不肯再来的了。厥后因为遇见你和渊如，感觉你们或答应以挽狂澜于既倒，才与你们北上，想着再指导你们一番。”