2001年9月25日，乔丹正式宣布复出，并和华盛顿奇才签订了为期2年的条约。乔丹在奇才的第一个赛季场均拿下23分。乔丹将他曾经的公牛教头道格・柯林斯请来奇才，试图晋升这支球队的气力。但在两年间，奇才均未能够打入季后赛。
984年9月12日，在NBA选秀大会上，乔丹被芝加哥公牛队选中，在全部联盟新秀中，他排在第3位，他的前面别离是哈基姆・奥拉朱旺和萨姆・鲍伊。从这时候起，直到初次登顶NBA总冠军，乔丹就一向是单打独斗的典范。
1999年，在劳资构和堕入僵局时，乔丹再度宣布退役，他表示“已经没有了开初作为篮球运动员时的应战目标”。
1984年的NBA选秀大会，乔丹在首轮第3顺位被芝加哥公牛队选中。[1]1986-87赛季，乔丹场均获得37.1分，初次获得分王称呼。[1]1990-91赛季，乔丹连夺通例赛MVP和总决赛MVP称呼，带领芝加哥公牛初次夺得NBA总冠军。1997-98赛季，乔丹获得小我职业生涯第10个得分王，并带领公牛队第六次夺得总冠军。在19年的职业生涯中，乔丹两次宣布退役（1993年以及1998年），并于2003年4月16日正式退役
乔丹在2002-03赛季场均获得20分，那一年，他插手了他的最后一届全明星赛。2002年11月28日，乔丹宣布，他将在赛季结束后第3次退役。2003年4月16日，在随华盛顿奇才出征费城76人的比赛中，乔丹打了职业生涯的最后一秒钟。他的球队持续2个赛季没有进入季后赛。
1986-87赛季开端，乔丹开端占有NBA记载册。这一年，他在前7场比赛中场均37.1分，赛季场均达到了30分。乔丹持续9场获得40或以上的分数，缔造联盟记载。在全明星周末，他夺得了扣篮大赛冠军，不过在季后赛，公牛仍然被凯尔特人首轮淘汰出局。
但是三连冠的高兴没多久，乔丹就接到凶信，他的父亲被行刺。就在新赛季练习营开端前，乔丹宣布退役，并筹办开端棒球生涯。棒球是父亲从小鼓励他处置的活动，乔丹也终究加盟了美国职棒联盟。究竟上，他在棒球场上并不太胜利。
1993年，乔丹带领公牛在五次季后赛中四次克服帕特里克・尤因带领的纽约尼克斯。在关头的第五场，乔丹打出了“三双”表示：29分、10个篮板和14次助攻。随后，公牛在六场内过关。在总决赛，乔丹在面对菲尼克斯太阳的六场比赛中缔造了一项记载：他场均获得了41.0分，胜利夺得三连冠
1990-91赛季，乔丹带领公牛一起高歌大进，全部季后赛仅仅输了两场，乔丹带领公牛第一次夺得总冠军。这此中包含在东部决赛中横扫活塞报了一箭之仇，在总决赛主场先负一局的环境下直落四局击败湖人夺冠。乔丹场均获得31.4分、6.4个篮板、8.4次助攻，并捧起了他六个NBA总决赛最有代价球员奖杯中的第一个。
1989-90赛季揭幕前，公牛队请来了菲尔・杰克逊。在“禅师”杰克逊的指教下，公牛引进三角打击。这个赛季，公牛55胜27负，创1971-72赛季以来队史最好战绩。乔丹在和骑士的比赛中缔造生涯最高得分69分。不过在1990年东部决赛中，公牛在七场鏖战中仍然输给了活塞。
2009年9月11日，迈克尔・乔丹正式当选NBA篮球名流堂。
1987-88赛季，乔丹拿下了通例赛得分王，最好戍守球员，全明星MVP，通例赛最有代价球员。季后赛首轮，乔丹带领公牛淘汰了骑士，无法第二轮1-4负于底特率活塞。