驻守在龙江的朱棣，突见奉天殿方向起火，赶快率军入宫，魏国公徐辉祖率军抵当，徐辉祖不敌，败下阵来。徐辉祖痛哭流涕：“太祖天子，江山就要易主了，臣故意抗燕，却已有力回天，臣对不起太祖天子。”徐辉祖哭罢，单独一人去了父祠，直至朱棣即位为帝，徐辉祖都在父祠当中不肯出来谒拜朱棣，朱棣一怒之下将徐辉祖关押在了天牢，幸有令仪为本身的长兄讨情，才令其返回私宅，得以善终。
既要即位称帝，就需求一名能服众的人来为朱棣草拟即位圣旨。方孝孺为当今大儒，名震天下，当然是草拟即位圣旨的首选人物，朱棣的即位圣旨如果能由方孝孺来草拟，那朱棣便在很大程度上博得了民气。因而朱棣请来了方孝孺草拟即位圣旨，朱棣毕恭毕敬地在大殿当中等着方孝孺，不料方孝孺却身着孝衣大哭着走上大殿。朱棣见状赶快走到方孝孺身前，笑着说道：“先生毋要自苦，本王只是效仿周公帮手成王。”方孝孺嘲笑一声，“现在成王安在？”“成王自焚而亡。”方孝孺又问：“怎不立成王之子？”“成王之子下落不明。”“嫡子不存，庶子还在。”“国赖长君。”“如何不立成王之弟？”朱棣有些不耐烦，“这是我皇家家事，不劳先生操心。”方孝孺狠狠盯着朱棣，泰然说道：“天下乃是太祖的天下，我身为大明臣子，就要顺从太祖遗训。”朱棣厉声叮咛侍从：“拿纸笔来，让方先生草诏。”方孝孺接过笔来，看着朱棣又是嘲笑一声，便奋笔疾书，书毕，将纸张交予朱棣，朱棣接过一看，上书：“燕贼篡位。”朱棣大怒，把纸张撕得粉碎。方孝孺指着朱棣骂道：“你这狗彘不若的谋逆乱臣，就算你登上皇位又如何？你必定永久受人唾骂。”气得浑身颤栗的朱棣指着方孝孺，“你若不草诏，本王便诛你九族？”方孝孺仰天大笑：“燕贼篡帝位，不得善终，忠臣死国难，虽死犹荣。戋戋燕贼，诛我九族何所惧？便诛十族又何如？”朱棣火冒三丈，大喊道：“好，本王成全你，诛方孝孺十族，聚宝门行刑。”方孝孺咬着牙齿骂道：“燕贼！燕贼！你永久是谋逆的燕贼，世世代代受人唾骂的篡位燕贼。”朱棣大喊道：“方孝孺九族及门放门生不得一人保存。”