段在国务院设立了“参陆办公处”以代替袁世凯期间的“率领办事处”。
6年6月，督军团纷繁独立时，黑龙江军务督办许兰洲也宣布独立，他不是对〖中〗央，而是对毕督军。毕桂芳向他停止商谈，愿以省长相让而留任督军。许的意义也想要督军，以还价还价，成果许愿任省长兼师长，但又传闻毕调兵侵占，顿时翻脸，限毕24小时内离省。
毕桂芳颁发寒电下野，推崇代理，段祺瑞并不接管毕的推举，6年7月26日，颁发鲍贵卿为黑龙江督军，命许仍回帮办原任。许赶走了毕桂芳，本身却登不上督军宝座。
冯国璋的第一道本钱是江苏督军李纯，冯国璋做了总统后，曾表示尊敬任务内阁制，对于段用人行政和决策的决定都不干与，段祺瑞对冯国璋在态度上也比对黎元洪时好很多。但是他们是两个气力派，冯国璋很故意机，段祺瑞则刚愎自用，冯国璋当然不肯意做一个和黎元洪一样的受气总统，段祺瑞则决不肯放弃半点权力，是以两人的争论，一样锋利化。