要说忍者的黄金光阴，还当数战国期间。忍者的品级轨制、练习内容、根基标准都肯定于这一期间。日本战国期间与中国的战国期间一样，到处充满了诡计与殛毙、残暴与叛变。为了相互排挤、争权夺利，各大名们常常互派忍者停止监督与渗入。忍者所具有的特别才气在这个期间有了广漠的用武之地。
战国期间，忍者生长迅猛，流派繁多，此中以伊贺与甲贺两派最为强大。伊贺与甲贺虽都地处群山地带，但是态度各别，相互仇视。伊贺忍者起先并未依从任何一个战国大名，但因其权势生长过快，遭到了当时欲同一日本的织田信长的顾忌。1581年9月，织田信长发重兵对伊贺展开了大范围剿灭，伊贺派初创人百地三太夫战死疆场，伊贺派权势遭到重创，后凭借于德川家康，在其图霸大业中立下汗马功绩，成为德川氏的御用忍者。
忍者另有“照顾食”一说，“照顾食”就是行动中为能随时弥补能量而照顾的食品，因为忍者一旦在某处履行任务，就不能随便分开特定位置，以免透露位置，这就需求随时能充饥的食品。这些“照顾食”首要有饭团、芋甲等。
俗话说，入他乡，随其俗，传入日本的“刺客”改名为“忍”，因其履行任务需意志固执且甘于孤单、心性哑忍而得名。但这也只就凡是称呼而言，在分歧的处所其称呼也有分歧。到了公元710年，“忍”被称作“标兵”，战国期间，叫法虽多，但以武田信玄定名的“乱波”最广为传播。“忍者”作为正式称呼牢固下来是在德川家康建立幕府今后。江户期间，战乱停歇，国度归于一统，以刺探军事谍报以及对敌方领袖展开暗害的忍者趋于式微。
对于忍者来讲，除了把握高超的忍术外，对自我的严格要求也是其脾气涵养的首要一面。所谓的严格要求也包含饮食方面的节制。因为忍者行动中必须常常性地待在狭小的空间里，是以，忍者必须保持肥大的体格，发胖对于忍者而言，是与被杀一样可骇的事情。以是，忍者在饮食方面极其慎重，有其特别的食谱，被称为“忍者食”。“忍者食”以稻米为主，配以平淡的蔬菜，而能快速增加体重、加强体味的食品则一概解除在外。
各种影视作品中所闪现的忍者的特异武功，实在是对其才气的夸大，固然忍者能自如天时用各种暗器，能去凡人所不能去的地点，有的还能在水中屏息几分钟，但这些异于凡人的本领都是靠常日的艰苦练习得来的，这些特异武功被统称为“忍术”。忍术的练习首要包含四个部分：肢体均衡、形体活络、体能、进犯技能。
至秦朝，刺客逐步生长成游侠群体，除暴安良。汉武帝时，游侠式微，但刺客行业还是存在。到南北朝乱世中，因朝廷斗争和对外战役的需求，刺客制造混乱以及汇集谍报的服从被强化，与此同时，刺客作为一种职业也获得完美。至唐朝，刺客由遣唐使引入日本。
作为深受中汉文明影响的国度，日本忍者也是自中土东渡而来。它最早的原型是中国古时的刺客。这些刺客都归属于必然的构造，受雇履行杀人任务。为了美满完成任务，刺客常常需求把握各种技能，包含利用暗器、攀爬窃听、扮装易容等等。刺客在春秋战国期间鼓起，因政治或其他启事替主家或某国国君撤除心头之患，在这一过程中也兼刺探谍报，专诸、聂政、荆轲等在《史记・刺客传记》中提及的这类人物便是典范代表。
相对于伊贺派最后的“自在之身”，甲贺派则非常自发地寻觅着本身的背景，先是六角氏，后为细川氏，再后依从于织田信长。依托其权势，甲贺派得以迅猛生长，本能寺之变后，甲贺派产生分裂，敏捷式微，至江户期间中期，几近销声匿迹。